Las nuevas estudiantes Mera y Raven se van de excursión a la ciudad de Mera, Atlantis, y descubren que la ciudad submarina ha desaparecido. Batgirl, Supergirl, Wonder Woman, Bumblebee, Raven, Miss Martian y Starfire detectan que el poderoso villano Brainiac, la ha encogido ¡y embotellado! Para infiltrarse en las ciudades embotelladas de Brainiac, Bumblebee y Raven idean un plan para reducir el tamaño de las heroínas. ¿Conseguirán salvar la ciudad perdida de Atlantis?